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第二十三章生理的网络思考


不同作用范围,阈值的信息传递,交叉进行:阈值小的对变化敏感,引发的变化在一定层次达到其他蛋白的作用阈值,再不断进行。伴随变化是网络式的,钠离子和钾离子,通透性变化

        (0期):刺激na少量内流阈电位激活快na通道na大量内流na平衡电位

        (1期)快na通道失活激活ito通道k一过性外流快速复极化

        2期:o期去极达40mv时已激活慢ca2通道激活ik通道ca2缓慢内流与k外流处于平衡状态缓慢复极化

        3期:慢ca2通道失活ik通道通透性k快速外流快速复极化至rp水平

        4期:因膜内[na]和[ca2]升高,而膜外[k]升高激活离子泵(双向的)泵出na和ca2,泵入k恢复正常离子分布。

        自律细胞4期的缓慢自动去极速率的不同导致的不同频率的搏动,异位搏动是一种缓冲的储备,这是高维的周期形成

        优势传导通路,概率

        速度的分布,突变点视为边界

        膜两侧存在浓度差:膜通透性具选择性

        对周期来说,整体的变化如钾的浓度是序列式的变化:钠通道通透性

        通道是一种缓冲的存储,也是一种阻力调节

        血压的形成是动力和阻力相互作用的结果。心脏射血和外周阻力的相互作用形成收缩压,大动脉的弹性回位力和外周阻力的相互作用形成舒张压。

        脉搏的波形是信息的耦合体,能量反映机体变化,其本征层次就是各种诊断。需要相对的作用?即大夫的脉搏的交互作用

        信号转导,本征层次的网络行为,是概率最大的路径

        信息的表达是持续的,修饰是网络的拓扑

        前馈控制,正负反馈,交叉抑制

        三原色的颜色合成

        研究生命活动现象和发生机制,以及在环境波动变化时的适应

        机体结构(解剖,组织,分子生物学层次)和生理功能的关系,以及器官和系统的功能整合

        第一章细胞膜和跨膜转运

        细胞器膜将特定的生物化学过程局限于小地方,细胞膜不仅是保持膜内细胞质与外界的一个势能差,使之耦合,它还是一个层次,与上下层次耦合,考虑用微分方程,如细胞膜蛋白和骨架蛋白和细胞外基质的作用

        膜有共性,不同细胞的膜甚至同一细胞不同地方的膜组分和结构都有差异,这可视为波函数的不同本征值求解:脂质双层膜,蛋白组成

        膜组分的自由扩散也是一种波函数,有的膜组分不能自由扩散如乙xian胆碱受体局限于骨骼肌运动终板,其他的一些蛋白则是遵循分布函数概率性地运动。若支配骨骼肌的运动神经被切断,乙xian胆碱受体就会扩散到肌细胞的整个质膜上,这可看作是持续性的作用是一种对波函数的操作,约束其扩散。在不同的位置的波函数是不同的如上皮细胞顶端和外基质存在不同的蛋白组成

        磷脂双分子层是膜通透性的结构基础,这是结构与功能的耦合;一些小比例的磷脂可在信号转导起关键作用,如磷脂酰肌醇二磷酸—磷脂酶c裂解肌醇1,4,5三磷酸(作用于内质网的受体,使ca2释放)二酰甘油(与ca2共同参与蛋白激酶c的激活)

        胆固醇起到一种限制膜流动性范围

        脂类,溶解偏向性(易溶于有机溶剂)

        饱和性,链结构,可否自体合成

        大比例的脂质,蛋白质,糖类的共存还可继续细化成更小层次的比例,如血清蛋白,免疫球蛋白等的比例,乃至于基因的比例,序列的碱基比例,不同比例的事物又分别有其不同的功能,能在更大尺度耦合。且比例的比例会体现出一定的相似性,会产生耦合,如脂质的胆固醇和蛋白质的受体的结合等。因此,为避免这种循环进行下去,我们要使用梯度,旋度和散度来统合。

        ds/dt=k(a)(c1c2)/x这是一种耦合

        浓度和电压依赖性是运输的麦克斯韦方程组的近似

        研究电信号或许能够整体把握离子的运输,通道蛋白的变形,各种分子的比例

        不同分子的平衡电位不可以相加,而应该是矩阵排列,视我们的批判标准来选取特定的本征值,即波函数的塌缩

        要维持一定的浓度差才有一定的稳态

        局部电位的可累积性是逻辑回路的一个基础

        ?三酰甘油代谢

        ?磷脂的代谢

        ?胆固醇的代谢

        ?脂肪酸源激素的代谢

        ?血浆脂蛋白代谢

        系统的不断包含,构建更高维的网络,网络的分子结构基础是一些公用的化学信息分子和受体,如递质甲状腺素和m,n1,n2受体。在系统这个复杂的微分方程中,分子和受体是其不同层次的本征值,其不同的效应是同一解的不同表达。这是一种耦合的表现。同时因为具有周期说明其在结构上也是耦合的

        不同层次的系统的耦合不一定是相同的,需要具体,如免疫系统的抗体细胞因子等。但重要的是识别,序列(抗体抗原)(递质受体)

        网络的拓扑性质:中心节点,连接的概率性,聚度,环路形成,网络簇结构,统计特性(比例),连接的中心节点优先,连接度的分布,适应性的表达,节点的淘汰机制(自然选择),簇内连接稠密、簇间接相对稀疏的相对封闭体的颗粒度,平均路径长度,聚度系数的分布(也是另一层次的自然选择),倾向性,正负关系,基于相似度的层次聚类

        网络簇结构的本质是能量的最低化和分布,与网络的其他复杂现象的必然联系是在演化的过程的必然的自然选择行为,网络自身的有关内在属性是节点群的运算

        网络的欧拉定理vef=2维度的级数运算,强调层次的往复。即楞次定律

        的抵抗性变化

        网络簇定义为网络的稠密连通分支,具有簇内连接稠密、簇间连接稀疏的特点,可视为最短化路径,即通路。同时也是一种倾向

        复杂网络的主要统计特征是小世界性、无标度性,并且结点度服从幂律分布

        无标度,即与网络的大小无关的特性

        聚类,物以类聚的倾向的研究,相似性,层次,子网络是低维的层次,其是微分方程的一个解,有其周期性,可耦合其他子网络的解构建新的网络

        低维封闭,高维相对是破缺的,这是哥德尔不完备律的一个体现

        网络是对最根本的关系的描述,这是从波函数的不可说层次的一过渡到关系的相对性的二再过渡到多个物体的概率连接

        一阶:度;二阶:群集系数,距离和平均距离

        “小世界”特性,即同时具有较小的平均最短路径长度和较大的群集系数

        线性空间,运算封闭

        1的可负性,即存储的势能

        2距离不是单向的,d(x,y)不一定等于d(y,x)

        3一维的距离相加abbc大于ac,高维的则因为概率的连接而不同

        高维的路径数增多,二维只有一条直线,三维有无数条曲线

        函数空间:元素加规则

        不动点原理在有限维的成立使得我们能够寻得近似值来指代方程,但无限维不成立。压缩映像,降维处理,必有一个不动点

        网络函数的无限维,若每部分的函数都是一致有界且连续,则网络是列紧的

        使用高阶算法,如积分

        频率,与路径长短成反比例,一定比例的倍数频率有和谐感

        分离变量法的级数表示,周期函数用傅里叶级数表示,以一定的函数作为基

        完备性:所有周期函数可被表示,但未必可被我们描述出来

        正交性使得函数相乘后的积分便于求解

        一个函数的微分对其傅里叶变换是一个乘法:将微分方程变换为代数方程,将函数的光滑性变成傅里叶变换的有界性

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